据国外最新医学研究发现，咖啡与心脏病、遗传疾病和精神病有密切关系，这主要是由于咖啡中含有大量的咖啡碱。美国波士顿麻醉品监测中心的人指出：如果每天喝5杯以上的咖啡就会增加心脏的负担，尤其对于那些富有竞争性的人来说，它有增加冠状动脉疾病的趋势；咖啡碱之所以能引起遗传疾病，是由于咖啡碱的化学结构与人体遗传基因DNA大分子中的一个酸的原子核非常类似，这样咖啡碱就有可能与DNA相结合，当这种结合发生时，就产生了细胞变异。
德国科学家证明了咖啡碱能破坏人类细胞的染色体。因此，1980年美国食品与药 品管理机构向怀孕和哺乳期的妇女提出警告，要她们限制对咖啡的摄取量，以防遗传性疾病的发生，70年代后期，美国的心理及业神病专家就咖啡碱对人们的性格影响做了大量的研究，发现在美国大学低年级的学生中喝咖啡的人都有较大的抑郁或焦虑感。
喝咖啡要注意三忌 一忌边喝咖啡边吸烟：因咖啡中的主要成分咖啡因上香烟中的尼古丁等诱变物质的作用下，易使身体中的某些组织发生异变，甚至导致癌细胞的产生。
二忌放糖太多：糖太多能反射性地刺激胰腺中的胰岛细胞分泌大量的胰岛素，而过量的胰岛素能降低血液中的葡萄糖含量，一旦血糖过低，会出现心悸、头晕、嗜睡等低血糖症状。
三忌浓度过高：可导致心跳加快，血压明显上升，并出现紧张不安、焦躁、耳鸣等异常现象。
